En este artículo realizamos un recorrido desde los orígenes de la «cooperación transfronteriza institucional» en Europa hasta la actual «cooperación territorial». Definimos y comparamos los conceptos de «cooperación institucional» y «cooperación tradicional” y auguramos un acercamiento entre ambas. Describimos el principal marco legal de la «cooperación transfronteriza institucional» y analizamos sus principales instrumentos, prestando una atención especial a la Eurorregión, a la Agrupación Europea de Interés Económico (AEIE) y a la más reciente figura de la Agrupación Europea de Cooperación Territorial (AECT), referentes todos importantes de la cooperación territorial. Finalizamos con algunas breves referencias a las dificultades de llevar a cabo la cooperación transfronteriza y al proyecto de integración europea, en el que la gestión de las fronteras interiores se ha convertido en un elemento esencial para consolidar el actual proceso de construcción de Europa.