Este artículo evalúa cómo el ecosistema de emprendimiento regional puede explicar el desempeño de las incubadoras de empresas y aceleradoras en España. Además, considera la importancia de un enfoque sistémico en el que las interrelaciones entre las incubadoras de empresas y las aceleradoras con el ecosistema empresarial sean fundamentales e innovadoras. Este tipo de relaciones se cuantifica por primera vez en España utilizando el índice regional (REDI) de la Comisión Europea mediante una amplia base de datos de las incubadoras y aceleradoras de empresas. Los resultados muestran una asociación positiva entre un REDI más alto y un mejor desempeño de las incubadoras de empresas y aceleradoras en esas regiones. Esto permite hacer sugerencias tanto para la política regional como de emprendimiento.